A paróquia foi criada no dia 09 de novembro de 1826 após ser desmembrada da freguesia de Furquim, recebendo o título de Capela São Miguel e Almas dos Arrepiados. Seu primeiro Vigário foi o Padre Joaquim José de Godoy, apresentado por carta imperial no dia 08 de novembro de 1828.
No ano de 1866, mudou a denominação da freguesia de São Miguel e Alma dos Arrepiados para São Miguel do Araponga, passando a pertencer ao município de Viçosa.
A terceira e atual Igreja Matriz iniciou sua construção em 1981, dois anos depois da tragédia de 1979, devido às chuvas. A construção da Igreja só ficou pronta 8 anos depois e sua inauguração aconteceu no dia 08/10/1989, dia em que comemoramos a Dedicação de nossa Igreja.
A Paróquia hoje é formada por 21 comunidades, sendo 18 comunidades rurais e três urbanas. A comunidade paroquial de São Miguel Arcanjo se destaca na história da Arquidiocese de Mariana pelo desenvolvimento das comunidades eclesiais de base.